
Si tratta di un arcipelago formato da tre isole maggiori e da alcuni scogli poggianti su un'unica piattaforma calcarea, situato nel mare Adriatico a 22 km a nord del Gargano. Dal punto di vista amministrativo costituisce un comune della provincia di Foggia. Le isole che lo compongono sono: San Domino (2,08 kmq.), San Nicola (0,41 kmq.), Caprara (0,44 kmq.); gli scogli maggiori, Cretaccio e la Vecchia.
L'isola di San Domino è la più estesa ed è quella che negli ultimi tempi ha conosciuto il maggiore sviluppo turistico e insediativo; ha una forma allungata ed è per lo più ricoperta da pinete e da una vegetazione a macchia mediterranea (alaterno, corbezzolo, lentisco e fillirea).
Fra le numerose grotte che si aprono specialmente lungo la costa sudoccidentale, ricordiamo
quella delle Rondinelle, delle Viole, del Sale, così chiamata perchè in passato costituiva un nascondiglio per i contrabbandieri di sale, del Bue Marino, nome con il quale le popolazioni locali indicavano la ormai estinta foca monaca.
San Nicola è l'isola più fertile ed è quasi totalmente coltivata; centro amministrativo dell'arcipelago, cui fanno capo i regolari servizi di navigazione provenienti da Termoli, Rodi Garganico, Vieste e Manfredonia, ospita nel centro di La Marina gli uffici comunali. Lungo le sue coste scoscese, in cui si aprono grotte come quelle della Madonna e del Ferraio, è possibile un unico approdo, di dove ha inizio un ripido viottolo che conduce all'abitato.